المجموعة الفرعية

Genome-Wide Association Study on the Seedless Phenotype in Banana

The GWAS panel is a list of diploid accessions (composed of Musa acuminata and AA) carefully selected to support Genome-Wide Association Study (GWAS) in banana in order to quickly and accurately link areas of the genome with important traits.

Accessions were fingerprinted using the Genotyping By Sequencing (GBS) method (Elshire RJ et al, 2011) using PSTI restriction enzyme (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA305234). A set of 129,658 unfiltered SNP markers were obtained that were subsequently filtered with a bioinformatic workflow at South Green Galaxy to get 5,544 robust SNP markers.

The filtered markers were deposited in dbSNP (ss#1971458520-1971464266). These SNPs mapped on DH Pahang v1 can be visualized on the JBrowse of the Banana Genome Hub (select GBS SNP panel)

المحاصيل
Banana
عدد المُدخلات
١٠٤
تاريخ الإنشاء
2016

البيانات التعريفية للمجموعة الفرعية


منشئو المجموعات الفرعية


قيِّم البيانات
Julie Sardos Bioversity International
قيِّم البيانات
Mathieu Rouard Bioversity International
قيِّم البيانات
Yann Hueber Bioversity International
قيِّم البيانات
Alberto Cenci Bioversity International
قيِّم البيانات
Katie E. Hyma Cornell University
قيِّم البيانات
Ines van den Houwe Bioversity International
قيِّم البيانات
Eva Hribova Institute of Experimental Botany
قيِّم البيانات
Brigitte Courtois CIRAD
قيِّم البيانات
Nicolas Roux Bioversity International

البيانات والموارد


بيانات هوية وصف الهوية متعدد المحاصيل

MCPD - 78dab905-6f22-4185-9190-5a9f45b59677.xlsx

Apply custom filters to accessions in this subset

Explore subset accessions on the map

المُدخلات

قائمة المُدخلات المضمنة في المجموعة الفرعية

١. ITC0063Musa aa • Pisang Tongat • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9J8J6
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9J8K7
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9J8TE
٤. ITC0090Musa aa • Tjau Lagada • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JA6N
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JMBD
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JMGJ
٧. ITC0258Musa aa • Pisang Madu • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JMNQ
٨. ITC0266Musa aa • Sowmuk • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JNEB
٩. ITC0267Musa aa • NBA 14 • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JNGD
١٠. ITC0281Musa aa • Akondro Mainty • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JP7U
١١. ITC0292Musa aa • Djum Tau • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • اندونيسيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JPPE
١٢. ITC0294Musa aa • Pitu • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JPRG
١٣. ITC0299Musa aa • Guyod • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • الفيلبين+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JPYP
١٤. ITC0310Musa aa subgr. pisang jari buaya • Morong Princesa • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JQK6
١٥. ITC0312Musa aa subgr. pisang jari buaya • Pisang Jari Buaya • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • ماليزيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JQQA
١٦. ITC0316Musa aa subgr. pisang jari buaya • Saing Todloh • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JR2N
١٧. ITC0318Musa aa subgr. pisang jari buaya • Not Named • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • اندونيسيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JR6S
١٨. ITC0373Musa aa • Uwati • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • بابوا غينيا الجديدة+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JVAE
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JVGM
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JVX~
٢١. ITC0395Musa aa • Lidi • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JW21
٢٢. ITC0406Musa acuminata Colla • Pa (Musore) no.3 • بري • تايلند+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JWKJ
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JWSR
٢٤. ITC0415Musa acuminata Colla • Pisang Cici Alas • بري • اندونيسيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JX5U
٢٥. ITC0434Musa aa • Racadag • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • الفيلبين+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JXYR
٢٦. ITC0437Musa aa • Pisang Kermian • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • ماليزيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JYF4
٢٧. ITC0446Musa aa • Pu-te La-Bum • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • ماليزيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JYZM
٢٨. ITC0447Musa aa • Pu-te Wey • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • ماليزيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JZ1P
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K0BV
٣٠. ITC0480Musa aa subgr. sucrier • Pisang Buntal • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • ماليزيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K14F
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K3WX
٣٢. ITC0533Musa aa • Kluai Lep Mu Nang • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K42=
٣٣. ITC0568Musa aa • Malaysian Blood • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K6E0
٣٤. ITC0600Musa aa • Waimara • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • بابوا غينيا الجديدة+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8CS
٣٥. ITC0602Musa acuminata subsp. banksii (F.Muell.) N.W.Simmonds • Hawain 3 • بري • بابوا غينيا الجديدة+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8GX
٣٦. ITC0603Musa aa • Somani • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • بابوا غينيا الجديدة+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8K*
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8V3
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8Z7
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K93B
٤٠. ITC0611Musa aa • Pisang Berlin • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K96E
٤١. ITC0612Musa aa • Mambee Thu • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K99H
٤٢. ITC0620Musa acuminata subsp. banksii (F.Muell.) N.W.Simmonds • Banksii • بري • بابوا غينيا الجديدة+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K9Y1
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KAMQ
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KCD6
٤٥. ITC0668Musa acuminata Colla • Pa (Musore) no.2 • بري • تايلند+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KCSJ
٤٦. ITC0679Musa aa • Pisang Sapon • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • اندونيسيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9M9VQ
٤٧. ITC0685Musa aa • Pisang Pipit • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • اندونيسيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KDN9
٤٨. ITC0689Musa aa • Pisang Bangkahulu • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • اندونيسيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KDVF
٤٩. ITC0712Musa aa • AAcv Rose • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • اندونيسيا+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KER7
٥٠. ITC0770Musa aa • Navaradam • الصنف التقليدي/ السلالة التقليدية • بابوا غينيا الجديدة+ إضافة إلى قائمتي
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KGZ4