Mini-core collection of potato landraces

The potato mini-core collection is a subset representing the majority of the genetic diversity contained in the entire potato landrace collection safeguarded by the International Potato Center (CIP) with little genetic redundancy. Mini core collections are generally about 1% of the entire germplasm collection and can be constructed from molecular markers, passport, or evaluation data.

The genebank at the CIP conserves, characterizes, and distributes wild and cultivated potato germplasm. As of June 2019, 4442 accessions of cultivated potato classified as landraces were maintained in the genebank. This collection is a global public good. All materials are distributed to requestors for use in research, training, and breeding upon acceptance of a Standard Material Transfer Agreement (SMTA). Genetic diversity analysis of the potato landrace collection using the SolCAP array provided the basis of information for the identification of 451 diverse accessions for a core collection representing the maximum genetic diversity with little redundancy. After establishing the core collection, a separate analysis was performed to select 45 diverse potato landrace accessions to generate a mini core collection, which corresponds to ~1% of the collection. This mini core collection will allow users to work with a diverse subset for faster evaluation of traits of interest and therefore to ultimately expand research towards identification of additional germplasm from the main landrace collection containing traits of importance. In this subset the 45 most diverse accessions of the potato landrace collection are presented and are available upon request

Colección mini-núcleo de papas tradicionales

La colección mini-núcleo es una muestra representativa con baja redundancia de la diversidad genética contenida en la colección principal de papas tradicionales custodiadas por el Centro Internacional de la Papa (CIP). Las colecciones mini núcleo están constituidas generalmente por un 1% de la colección principal y pueden ser desarrolladas a partir de marcadores moleculares, datos de pasaporte o evaluación fenotípica.

El banco de germoplasma del CIP conserva, caracteriza y distribuye el germoplasma silvestre y cultivado de papa. A junio de 2019, 4442 accesiones clasificadas como papa tradicional eran mantenidas en custodia. Esta diversidad es un bien público a nivel mundial, por lo que se distribuye usando un Acuerdo Estandarizado de Transferencia de Material (AETM) para uso en investigación, capacitación, y mejoramiento. Un análisis de diversidad genética de la colección de papas tradicionales usando el chip de SolCAP con marcadores de polimorfismo de nucleótido simple (SNP por la sigla en inglés) permitió la identificación de 451 accesiones que constituyen la colección núcleo que representan la máxima diversidad genética con menor redundancia. Después de establecer la colección núcleo, se realizó un segundo análisis para seleccionar las 45 accesiones de papa tradicionales más diversas que conforman la colección mini núcleo, la cual corresponde a 1% de la colección principal. Esta representatividad permitirá hacer evaluaciones más rápidas de caracteres relacionados con resistencias o tolerancias a factores bióticos o abióticos, y por lo tanto a ampliar la búsqueda enfocada al germoplasma en el clúster que representan dentro de la colección de papas tradiciones. En esta selección se presentan las 45 accesiones más diversas de la colección de papas tradicionales

Crop
Potato
Number of accessions
45
FAO WIEWS Institute code
Creation date
2016
Published in Genesys
20 October 2019
Subset metadata

Subset creators


Data manager
David Ellis International Potato Center (CIP)

Data and resources


MCPD passport data

MCPD - 1da1e9e5-aa0a-47eb-83aa-7bb496107845.xlsx

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Accessions

List of accessions included in the subset

2. CIP 701445Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Alqa Piña • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/95NU
PER001 • DOI: 10.18730/97HP
4. CIP 702208Solanum chaucha Juz. & Bukasov • Muru Piña • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9B8Y
5. CIP 702343Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Migajosa • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9CJ=
6. CIP 702472Solanum stenotomum Juz. & Bukasov subsp. goniocalyx (Juz. & Bukasov) Hawkes • Amarilla del Centro • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9DM*
7. CIP 702650Solanum ajanhuiri Juz. & Bukasov • Wila Yari • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/9EY0
8. CIP 702853Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Alca Tarma • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9GB8
9. CIP 702937Solanum curtilobum Juz. & Bukasov • Choquepito o Laram Ocucuri • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9H1Y
10. CIP 703282Solanum stenotomum Juz. & Bukasov subsp. goniocalyx (Juz. & Bukasov) Hawkes • Ishkupuru • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9K3P
11. CIP 703318Solanum stenotomum Juz. & Bukasov subsp. stenotomum (Juz. & Bukasov) Hawkes • Titipa Sapin • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9M2G
12. CIP 703457Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Criolla • Traditional cultivar/Landrace • VEN
PER001 • DOI: 10.18730/9PX~
13. CIP 703506Solanum phureja Juz. & Bukasov • Papa Ibia Rosada • Traditional cultivar/Landrace • COL
PER001 • DOI: 10.18730/9R4=
14. CIP 703520Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Pestañuda • Traditional cultivar/Landrace • COL
PER001 • DOI: 10.18730/9RHB
15. CIP 703649Solanum chaucha Juz. & Bukasov • Kulurara • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/9W2D
16. CIP 703654Solanum phureja Juz. & Bukasov • Chaucha Amarilla • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/9W7J
17. CIP 703810Solanum ajanhuiri Juz. & Bukasov • Azul Ahanwiri • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/A0J9
18. CIP 703971Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Muru Niño • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/A4X0
19. CIP 704057Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • ECU
PER001 • DOI: 10.18730/A7G9
20. CIP 704178Solanum tuberosum C.Linneo subsp. tuberosum Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • CHL
PER001 • DOI: 10.18730/AAV5
21. CIP 704203Solanum phureja Juz. & Bukasov • Chaucha Naranjilla Rosada • Traditional cultivar/Landrace • ECU
PER001 • DOI: 10.18730/ABKX
22. CIP 704393Solanum stenotomum Juz. & Bukasov subsp. goniocalyx (Juz. & Bukasov) Hawkes • María Cruz • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/AGC$
23. CIP 704406Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Coloradas Almidonas • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/AGR9
24. CIP 704501Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Sali Imilla • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/AKKT
25. CIP 704767Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Jancko Papa • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/AVFK
26. CIP 704980Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Urna Cuchni • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/B1HW
27. CIP 705053Solanum tuberosum C.Linneo subsp. tuberosum Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • CHL
PER001 • DOI: 10.18730/B3MN
28. CIP 705068Solanum tuberosum C.Linneo subsp. tuberosum Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • CHL
PER001 • DOI: 10.18730/B40~
29. CIP 705127Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Tocana Blanca • Traditional cultivar/Landrace • COL
PER001 • DOI: 10.18730/B5RF
30. CIP 705197Solanum phureja Juz. & Bukasov • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • ECU
PER001 • DOI: 10.18730/B7N2
31. CIP 705352Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Moronga 6 Pintada • Traditional cultivar/Landrace • ECU
PER001 • DOI: 10.18730/BC0Y
32. CIP 705378Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Leona Negra • Traditional cultivar/Landrace • ECU
PER001 • DOI: 10.18730/BCNE
33. CIP 705407Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Yema • Traditional cultivar/Landrace • MEX
PER001 • DOI: 10.18730/BDF3
34. CIP 705802Solanum phureja Juz. & Bukasov • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • COL
PER001 • DOI: 10.18730/BSFH
35. CIP 705834Solanum stenotomum Juz. & Bukasov subsp. stenotomum (Juz. & Bukasov) Hawkes • Yana Pitiquiña • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/BTDA
PER001 • DOI: 10.18730/BXK1
37. CIP 706050Solanum juzepczukii Bukasov • K'anchillo • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/C09D
38. CIP 706310Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/C75B
39. CIP 706679Solanum tuberosum C.Linneo subsp. tuberosum Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • CHL
PER001 • DOI: 10.18730/CH3~
40. CIP 706699Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • ARG
PER001 • DOI: 10.18730/CHMD
41. CIP 706713Solanum tuberosum C.Linneo subsp. andigena (Juz. & Bukasov) Hawkes • Unknown • Traditional cultivar/Landrace • ARG
PER001 • DOI: 10.18730/CJ0S
42. CIP 706776Solanum curtilobum Juz. & Bukasov • Lucki • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/CKS8
43. CIP 706777Solanum juzepczukii Bukasov • Saylo Lucki • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/CKT9
44. CIP 706845Solanum stenotomum Juz. & Bukasov subsp. stenotomum (Juz. & Bukasov) Hawkes • Chiar Pitohuayaka • Traditional cultivar/Landrace • BOL
PER001 • DOI: 10.18730/CNTU
45. CIP 707129Solanum chaucha Juz. & Bukasov • Wayru • Traditional cultivar/Landrace • PER
PER001 • DOI: 10.18730/CS5*