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Mini-core collection of potato landraces

The potato mini-core collection is a subset representing the majority of the genetic diversity contained in the entire potato landrace collection safeguarded by the International Potato Center (CIP) with little genetic redundancy. Mini core collections are generally about 1% of the entire germplasm collection and can be constructed from molecular markers, passport, or evaluation data.

The genebank at the CIP conserves, characterizes, and distributes wild and cultivated potato germplasm. As of June 2019, 4442 accessions of cultivated potato classified as landraces were maintained in the genebank. This collection is a global public good. All materials are distributed to requestors for use in research, training, and breeding upon acceptance of a Standard Material Transfer Agreement (SMTA). Genetic diversity analysis of the potato landrace collection using the SolCAP array provided the basis of information for the identification of 451 diverse accessions for a core collection representing the maximum genetic diversity with little redundancy. After establishing the core collection, a separate analysis was performed to select 45 diverse potato landrace accessions to generate a mini core collection, which corresponds to ~1% of the collection. This mini core collection will allow users to work with a diverse subset for faster evaluation of traits of interest and therefore to ultimately expand research towards identification of additional germplasm from the main landrace collection containing traits of importance. In this subset the 45 most diverse accessions of the potato landrace collection are presented and are available upon request

Colección mini-núcleo de papas tradicionales

La colección mini-núcleo es una muestra representativa con baja redundancia de la diversidad genética contenida en la colección principal de papas tradicionales custodiadas por el Centro Internacional de la Papa (CIP). Las colecciones mini núcleo están constituidas generalmente por un 1% de la colección principal y pueden ser desarrolladas a partir de marcadores moleculares, datos de pasaporte o evaluación fenotípica.

El banco de germoplasma del CIP conserva, caracteriza y distribuye el germoplasma silvestre y cultivado de papa. A junio de 2019, 4442 accesiones clasificadas como papa tradicional eran mantenidas en custodia. Esta diversidad es un bien público a nivel mundial, por lo que se distribuye usando un Acuerdo Estandarizado de Transferencia de Material (AETM) para uso en investigación, capacitación, y mejoramiento. Un análisis de diversidad genética de la colección de papas tradicionales usando el chip de SolCAP con marcadores de polimorfismo de nucleótido simple (SNP por la sigla en inglés) permitió la identificación de 451 accesiones que constituyen la colección núcleo que representan la máxima diversidad genética con menor redundancia. Después de establecer la colección núcleo, se realizó un segundo análisis para seleccionar las 45 accesiones de papa tradicionales más diversas que conforman la colección mini núcleo, la cual corresponde a 1% de la colección principal. Esta representatividad permitirá hacer evaluaciones más rápidas de caracteres relacionados con resistencias o tolerancias a factores bióticos o abióticos, y por lo tanto a ampliar la búsqueda enfocada al germoplasma en el clúster que representan dentro de la colección de papas tradiciones. En esta selección se presentan las 45 accesiones más diversas de la colección de papas tradicionales

محصولات
Potato
تعداد افزونه
45
تاریخ ایجاد
2016

ابرداده‌های زیرمجموعه


ایجادکنندگان زیرمجموعه


نگهدارنده داده
Rene Gomez International Potato Center (CIP)
جمع‌آوری کننده داده
Julian Soto International Potato Center (CIP)
جمع‌آوری کننده داده
Marisol Durand International Potato Center (CIP)
مدیر داده
David Ellis International Potato Center (CIP)

داده‌ها و منابع


داده‌های گذرنامه MCPD

MCPD - 1da1e9e5-aa0a-47eb-83aa-7bb496107845.xlsx

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افزونه‌ها

فهرست افزونه‌های گنجانده شده در زیرمجموعه

PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/91RP
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/95NU
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/97HP
4. CIP 702208Solanum chaucha Juz. & Bukasov • Muru Piña • گونه سنتی/رقم بومی • Peru+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9B8Y
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9CJ=
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9DM*
7. CIP 702650Solanum ajanhuiri Juz. & Bukasov • Wila Yari • گونه سنتی/رقم بومی • Bolivia+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9EY0
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9GB8
9. CIP 702937Solanum curtilobum Juz. & Bukasov • Choquepito o Laram Ocucuri • گونه سنتی/رقم بومی • Peru+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9H1Y
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9K3P
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9M2G
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9PX~
13. CIP 703506Solanum phureja Juz. & Bukasov • Papa Ibia Rosada • گونه سنتی/رقم بومی • Colombia+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9R4=
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9RHB
15. CIP 703649Solanum chaucha Juz. & Bukasov • Kulurara • گونه سنتی/رقم بومی • Bolivia+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9W2D
16. CIP 703654Solanum phureja Juz. & Bukasov • Chaucha Amarilla • گونه سنتی/رقم بومی • Peru+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/9W7J
17. CIP 703810Solanum ajanhuiri Juz. & Bukasov • Azul Ahanwiri • گونه سنتی/رقم بومی • Peru+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/A0J9
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/A4X0
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/A7G9
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/AAV5
21. CIP 704203Solanum phureja Juz. & Bukasov • Chaucha Naranjilla Rosada • گونه سنتی/رقم بومی • Ecuador+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/ABKX
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/AGC$
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/AGR9
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/AKKT
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/AVFK
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/B1HW
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/B3MN
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/B40~
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/B5RF
30. CIP 705197Solanum phureja Juz. & Bukasov • Unknown • گونه سنتی/رقم بومی • Ecuador+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/B7N2
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/BC0Y
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/BCNE
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/BDF3
34. CIP 705802Solanum phureja Juz. & Bukasov • Unknown • گونه سنتی/رقم بومی • Colombia+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/BSFH
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/BTDA
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/BXK1
37. CIP 706050Solanum juzepczukii Bukasov • K'anchillo • گونه سنتی/رقم بومی • Peru+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/C09D
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/C75B
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/CH3~
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/CHMD
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/CJ0S
42. CIP 706776Solanum curtilobum Juz. & Bukasov • Lucki • گونه سنتی/رقم بومی • Bolivia+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/CKS8
43. CIP 706777Solanum juzepczukii Bukasov • Saylo Lucki • گونه سنتی/رقم بومی • Bolivia+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/CKT9
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/CNTU
45. CIP 707129Solanum chaucha Juz. & Bukasov • Wayru • گونه سنتی/رقم بومی • Peru+ افزودن به فهرست من
PER001Centro Internacional de la Papa, Peru • DOI: 10.18730/CS5*