زیرمجموعه

Genome-Wide Association Study on the Seedless Phenotype in Banana

The GWAS panel is a list of diploid accessions (composed of Musa acuminata and AA) carefully selected to support Genome-Wide Association Study (GWAS) in banana in order to quickly and accurately link areas of the genome with important traits.

Accessions were fingerprinted using the Genotyping By Sequencing (GBS) method (Elshire RJ et al, 2011) using PSTI restriction enzyme (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA305234). A set of 129,658 unfiltered SNP markers were obtained that were subsequently filtered with a bioinformatic workflow at South Green Galaxy to get 5,544 robust SNP markers.

The filtered markers were deposited in dbSNP (ss#1971458520-1971464266). These SNPs mapped on DH Pahang v1 can be visualized on the JBrowse of the Banana Genome Hub (select GBS SNP panel)

محصولات
Banana
تعداد افزونه
۱۰۴
تاریخ ایجاد
2016

ابرداده‌های زیرمجموعه


ایجادکنندگان زیرمجموعه


نگهدارنده داده
Julie Sardos Bioversity International
نگهدارنده داده
Mathieu Rouard Bioversity International
نگهدارنده داده
Yann Hueber Bioversity International
نگهدارنده داده
Alberto Cenci Bioversity International
نگهدارنده داده
Katie E. Hyma Cornell University
نگهدارنده داده
Ines van den Houwe Bioversity International
نگهدارنده داده
Eva Hribova Institute of Experimental Botany
نگهدارنده داده
Brigitte Courtois CIRAD
نگهدارنده داده
Nicolas Roux Bioversity International

داده‌ها و منابع


داده‌های گذرنامه MCPD

MCPD - 78dab905-6f22-4185-9190-5a9f45b59677.xlsx

Apply custom filters to accessions in this subset

Explore subset accessions on the map

افزونه‌ها

فهرست افزونه‌های گنجانده شده در زیرمجموعه

۱. ITC0063Musa aa • Pisang Tongat • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9J8J6
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9J8K7
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9J8TE
۴. ITC0090Musa aa • Tjau Lagada • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JA6N
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JMBD
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JMGJ
۷. ITC0258Musa aa • Pisang Madu • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JMNQ
۸. ITC0266Musa aa • Sowmuk • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JNEB
۹. ITC0267Musa aa • NBA 14 • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JNGD
۱۰. ITC0281Musa aa • Akondro Mainty • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JP7U
۱۱. ITC0292Musa aa • Djum Tau • گونه سنتی/رقم بومی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JPPE
۱۲. ITC0294Musa aa • Pitu • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JPRG
۱۳. ITC0299Musa aa • Guyod • گونه سنتی/رقم بومی • فیلیپین+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JPYP
۱۴. ITC0310Musa aa subgr. pisang jari buaya • Morong Princesa • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JQK6
۱۵. ITC0312Musa aa subgr. pisang jari buaya • Pisang Jari Buaya • گونه سنتی/رقم بومی • مالزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JQQA
۱۶. ITC0316Musa aa subgr. pisang jari buaya • Saing Todloh • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JR2N
۱۷. ITC0318Musa aa subgr. pisang jari buaya • Not Named • گونه سنتی/رقم بومی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JR6S
۱۸. ITC0373Musa aa • Uwati • گونه سنتی/رقم بومی • گوینیا ی جدید پاپوا+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JVAE
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JVGM
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JVX~
۲۱. ITC0395Musa aa • Lidi • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JW21
۲۲. ITC0406Musa acuminata Colla • Pa (Musore) no.3 • وحشی • تایلند+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JWKJ
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JWSR
۲۴. ITC0415Musa acuminata Colla • Pisang Cici Alas • وحشی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JX5U
۲۵. ITC0434Musa aa • Racadag • گونه سنتی/رقم بومی • فیلیپین+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JXYR
۲۶. ITC0437Musa aa • Pisang Kermian • گونه سنتی/رقم بومی • مالزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JYF4
۲۷. ITC0446Musa aa • Pu-te La-Bum • گونه سنتی/رقم بومی • مالزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JYZM
۲۸. ITC0447Musa aa • Pu-te Wey • گونه سنتی/رقم بومی • مالزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9JZ1P
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K0BV
۳۰. ITC0480Musa aa subgr. sucrier • Pisang Buntal • گونه سنتی/رقم بومی • مالزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K14F
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K3WX
۳۲. ITC0533Musa aa • Kluai Lep Mu Nang • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K42=
۳۳. ITC0568Musa aa • Malaysian Blood • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K6E0
۳۴. ITC0600Musa aa • Waimara • گونه سنتی/رقم بومی • گوینیا ی جدید پاپوا+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8CS
۳۵. ITC0602Musa acuminata subsp. banksii (F.Muell.) N.W.Simmonds • Hawain 3 • وحشی • گوینیا ی جدید پاپوا+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8GX
۳۶. ITC0603Musa aa • Somani • گونه سنتی/رقم بومی • گوینیا ی جدید پاپوا+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8K*
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8V3
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K8Z7
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K93B
۴۰. ITC0611Musa aa • Pisang Berlin • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K96E
۴۱. ITC0612Musa aa • Mambee Thu • گونه سنتی/رقم بومی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K99H
۴۲. ITC0620Musa acuminata subsp. banksii (F.Muell.) N.W.Simmonds • Banksii • وحشی • گوینیا ی جدید پاپوا+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9K9Y1
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KAMQ
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KCD6
۴۵. ITC0668Musa acuminata Colla • Pa (Musore) no.2 • وحشی • تایلند+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KCSJ
۴۶. ITC0679Musa aa • Pisang Sapon • گونه سنتی/رقم بومی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9M9VQ
۴۷. ITC0685Musa aa • Pisang Pipit • گونه سنتی/رقم بومی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KDN9
۴۸. ITC0689Musa aa • Pisang Bangkahulu • گونه سنتی/رقم بومی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KDVF
۴۹. ITC0712Musa aa • AAcv Rose • گونه سنتی/رقم بومی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KER7
۵۰. ITC0770Musa aa • Navaradam • گونه سنتی/رقم بومی • گوینیا ی جدید پاپوا+ افزودن به فهرست من
BEL084Bioversity International Musa Germplasm Transit Centre, Belgium • DOI: 10.18730/9KGZ4