زیرمجموعه

High-density rice array (HDRA) RDP1

These are entries in the panel from USDA/Cornell for use on the high-density rice array (HDRA) comprised of 700K single-nucleotide polymorphisms (SNPs). The HDRA represented the most densely populated genotyping array available for any organism at that time, based on the number of SNPs/kb interrogated across the genome. The value of these resources for genome-wide association studies (GWAS) was explored using grain length as the phenotype, and use numerous analytical techniques to identify significant associations that uncover both major and minor QTLs. Distinct advantages of cross-population mapping were demonstrated, gaining power by directly accounting for large effect alleles from within the mapping model. It was shown how this may lead to the identification of population-specific haplotypes, which are of particular value to the plant breeder.

McCouch et al 2016, Open access resources for genome-wide association mapping in rice, Nature Comm. 10.1038/ncomms10532

محصولات
Rice
تعداد افزونه
۴۱۰
تاریخ ایجاد
2016

ابرداده‌های زیرمجموعه


ایجادکنندگان زیرمجموعه


نگهدارنده داده
Dr. Kenneth L. McNally IRRI

داده‌ها و منابع


داده‌های گذرنامه MCPD

MCPD - 1962c499-dc2c-46f8-8202-24b5ec445f38.xlsx

Apply custom filters to accessions in this subset

Explore subset accessions on the map

افزونه‌ها

فهرست افزونه‌های گنجانده شده در زیرمجموعه

۱. IRGC 117264Oryza sativa Linnaeus • AZUCENA • سویه ژنتیکی • فیلیپین+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZFQ
۲. IRGC 117265Oryza sativa Linnaeus • DOM SUFID • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/1PG6J
۳. IRGC 117266Oryza sativa Linnaeus • DULAR • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZGR
۴. IRGC 117267Oryza sativa Linnaeus • FR 13 A • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZHS
۵. IRGC 117268Oryza sativa Linnaeus • IR 64-21 • سویه ژنتیکی • فیلیپین+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZJT
۶. IRGC 117269Oryza sativa Linnaeus • LI-JIANG-XIN-TUAN-HEI-GU • سویه ژنتیکی • چین+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZKV
۷. IRGC 117270Oryza sativa Linnaeus • M 202 • سویه ژنتیکی • ایالات متحده+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZMW
۸. IRGC 117271Oryza sativa Linnaeus • MINGHUI 63 • سویه ژنتیکی • چین+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZNX
۹. IRGC 117272Oryza sativa Linnaeus • MOROBEREKAN • سویه ژنتیکی • گوینیا+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZPY
۱۰. IRGC 117273Oryza sativa Linnaeus • N 22 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZQZ
۱۱. IRGC 117274Oryza sativa Linnaeus • NIPPONBARE • سویه ژنتیکی • ژاپن+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZR*
۱۲. IRGC 117276Oryza sativa Linnaeus • SADU CHO • سویه ژنتیکی • کره ی جنوبی+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZT$
۱۳. IRGC 117277Oryza sativa Linnaeus • SANHUANGZHAN NO 2 • سویه ژنتیکی • چین+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZV=
۱۴. IRGC 117279Oryza sativa Linnaeus • TAINUNG 67 • سویه ژنتیکی • تایوان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZX0
۱۵. IRGC 117280Oryza sativa Linnaeus • ZHENSHAN 97 B • سویه ژنتیکی • چین+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZY1
۱۶. IRGC 117282Oryza sativa Linnaeus • CYPRESS • سویه ژنتیکی • ایالات متحده+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CMZD
۱۷. IRGC 117599Oryza sativa Linnaeus • 27 • سویه ژنتیکی • جمهوری دومونیکا+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X45S
۱۸. IRGC 117600Oryza sativa Linnaeus • AIJIAONANTE • سویه ژنتیکی • چین+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X46T
۱۹. IRGC 117601Oryza sativa Linnaeus • ARC 10177 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X47V
۲۰. IRGC 117602Oryza sativa Linnaeus • ARC 6578 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X48W
۲۱. IRGC 117603Oryza sativa Linnaeus • ARC 7229 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X49X
۲۲. IRGC 117604Oryza sativa Linnaeus • ASD 1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4AY
۲۳. IRGC 117605Oryza sativa Linnaeus • BASMATI 1 • سویه ژنتیکی • پاکستان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4BZ
۲۴. IRGC 117606Oryza sativa Linnaeus • C57-5043 • سویه ژنتیکی • ایالات متحده+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4C*
۲۵. IRGC 117607Oryza sativa Linnaeus • CAROLINA GOLD • سویه ژنتیکی • ایالات متحده+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4D~
۲۶. IRGC 117608Oryza sativa Linnaeus • CAROLINA GOLD SEL • سویه ژنتیکی • ایالات متحده+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4E$
۲۷. IRGC 117609Oryza sativa Linnaeus • CS-M3 • سویه ژنتیکی • ایالات متحده+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4F=
۲۸. IRGC 117610Oryza sativa Linnaeus • DZ78 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4GU
۲۹. IRGC 117611Oryza sativa Linnaeus • GERDEH • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4H0
۳۰. IRGC 117612Oryza sativa Linnaeus • GEUMOBYEO • سویه ژنتیکی • کره ی جنوبی+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4J1
۳۱. IRGC 117613Oryza sativa Linnaeus • HABIGANJ BORO 6 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4K2
۳۲. IRGC 117614Oryza sativa Linnaeus • HON CHIM • سویه ژنتیکی • هنگ‌کنگ+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4M3
۳۳. IRGC 117615Oryza sativa Linnaeus • IAC 25 • سویه ژنتیکی • برزیل+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4N4
۳۴. IRGC 117616Oryza sativa Linnaeus • ITALICA CAROLINA • سویه ژنتیکی • اتریش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4P5
۳۵. IRGC 117617Oryza sativa Linnaeus • KASALATH • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4Q6
۳۶. IRGC 117618Oryza sativa Linnaeus • KERITING TINGGI • سویه ژنتیکی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4R7
۳۷. IRGC 117619Oryza sativa Linnaeus • LEUNG PRATEW • سویه ژنتیکی • تایلند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4S8
۳۸. IRGC 117620Oryza sativa Linnaeus • MEHR • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4T9
۳۹. IRGC 117621Oryza sativa Linnaeus • MOROBEREKAN • سویه ژنتیکی • گوینیا+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4VA
۴۰. IRGC 117622Oryza sativa Linnaeus • RTS 14 • سویه ژنتیکی • ویتنام+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4WB
۴۱. IRGC 117623Oryza sativa Linnaeus • BR24 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4XC
۴۲. IRGC 117624Oryza sativa Linnaeus • KIUKI NO. 46 • سویه ژنتیکی • ژاپن+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4YD
۴۳. IRGC 117625Oryza sativa Linnaeus • SML 242 • سویه ژنتیکی • سورینام+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4ZE
۴۴. IRGC 117626Oryza sativa Linnaeus • WC 4419 • سویه ژنتیکی • هوندوراس+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X50F
۴۵. IRGC 117627Oryza sativa Linnaeus • 1021 • سویه ژنتیکی • گواتمالا+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X51G
۴۶. IRGC 117628Oryza sativa Linnaeus • 205 • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X52H
۴۷. IRGC 117629Oryza sativa Linnaeus • 318 • سویه ژنتیکی • ترکیه+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X53J
۴۸. IRGC 117630Oryza sativa Linnaeus • 519 • سویه ژنتیکی • اوروگوئه+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X54K
۴۹. IRGC 117631Oryza sativa Linnaeus • 56-122-23 • سویه ژنتیکی • تایلند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X55M
۵۰. IRGC 117632Oryza sativa Linnaeus • 583 • سویه ژنتیکی • اکوادور+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X56N