زیرمجموعه

High-density rice array (HDRA) RDP2

These are entries in the panel from IRRI for use on the high-density rice array (HDRA) comprised of 700K single-nucleotide polymorphisms (SNPs). The HDRA represented the most densely populated genotyping array available for any organism at that time, based on the number of SNPs/kb interrogated across the genome. The value of these resources for genome-wide association studies (GWAS) was explored using grain length as the phenotype, and use numerous analytical techniques to identify significant associations that uncover both major and minor QTLs. Distinct advantages of cross-population mapping were demonstrated, gaining power by directly accounting for large effect alleles from within the mapping model. It was shown how this may lead to the identification of population-specific haplotypes, which are of particular value to the plant breeder.

McCouch et al 2016, Open access resources for genome-wide association mapping in rice, Nature Comm. 10.1038/ncomms10532

محصولات
Rice
تعداد افزونه
۱٬۴۲۵
تاریخ ایجاد
2016

ابرداده‌های زیرمجموعه


ایجادکنندگان زیرمجموعه


نگهدارنده داده
Dr. Kenneth L. McNally International Rice Research Institute

داده‌ها و منابع


داده‌های گذرنامه MCPD

MCPD - d4242b86-c368-4d81-a50d-5bbb709733d3.xlsx

Apply custom filters to accessions in this subset

Explore subset accessions on the map

افزونه‌ها

فهرست افزونه‌های گنجانده شده در زیرمجموعه

۱. IRGC 117275Oryza sativa Linnaeus • POKKALI • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZS~
۲. IRGC 117278Oryza sativa Linnaeus • SWARNA • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZWU
۳. IRGC 117281Oryza sativa Linnaeus • ASWINA • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CMYC
۴. IRGC 117283Oryza sativa Linnaeus • RAYADA • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CN0E
۵. IRGC 117419Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 32380-1 • سویه ژنتیکی • باتان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CN2G
۶. IRGC 117420Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 55441-1 • سویه ژنتیکی • کره ی جنوبی+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CN3H
۷. IRGC 117424Oryza sativa Linnaeus • ARC 10317::IRGC 12430-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CN7N
۸. IRGC 117425Oryza sativa Linnaeus • ARC 10497::IRGC 12485-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CN8P
۹. IRGC 117426Oryza sativa Linnaeus • ARC 13829::IRGC 42469-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CN9Q
۱۰. IRGC 117429Oryza sativa Linnaeus • AUS JOTA::IRGC 66767-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNCT
۱۱. IRGC 117434Oryza sativa Linnaeus • BARAN BORO::IRGC 27509-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNHZ
۱۲. IRGC 117438Oryza sativa Linnaeus • BASMATI LAMO::IRGC 58881-1 • سویه ژنتیکی • نپال+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNN=
۱۳. IRGC 117439Oryza sativa Linnaeus • BICO BRANCO::IRGC 38994-1 • سویه ژنتیکی • برزیل+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNPU
۱۴. IRGC 117440Oryza sativa Linnaeus • CANA ROXA::IRGC 25966-1 • سویه ژنتیکی • برزیل+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNQ0
۱۵. IRGC 117443Oryza sativa Linnaeus • CERE AIR::IRGC 43369-1 • سویه ژنتیکی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNT3
۱۶. IRGC 117444Oryza sativa Linnaeus • CHAHORA 144::IRGC 27869-1 • سویه ژنتیکی • پاکستان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNV4
۱۷. IRGC 117446Oryza sativa Linnaeus • CHHOTE DHAN::IRGC 58930-1 • سویه ژنتیکی • نپال+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNX6
۱۸. IRGC 117447Oryza sativa Linnaeus • CHITRAJ (DA 23)::IRGC 6208-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CNY7
۱۹. IRGC 117449Oryza sativa Linnaeus • CHUAN 3::IRGC 17051-1 • سویه ژنتیکی • تایوان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP09
۲۰. IRGC 117450Oryza sativa Linnaeus • CHUAN 4::IRGC 17052-1 • سویه ژنتیکی • تایوان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP1A
۲۱. IRGC 117451Oryza sativa Linnaeus • CICIH BETON::IRGC 43372-1 • سویه ژنتیکی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP2B
۲۲. IRGC 117453Oryza sativa Linnaeus • CO 25::IRGC 3697-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP4D
۲۳. IRGC 117454Oryza sativa Linnaeus • CO 39::IRGC 51231-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP5E
۲۴. IRGC 117455Oryza sativa Linnaeus • DA 1::IRGC 45624-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP6F
۲۵. IRGC 117456Oryza sativa Linnaeus • DA 13::IRGC 5857-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP7G
۲۶. IRGC 117457Oryza sativa Linnaeus • DA 16::IRGC 6245-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP8H
۲۷. IRGC 117458Oryza sativa Linnaeus • DA 28::IRGC 6246-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CP9J
۲۸. IRGC 117459Oryza sativa Linnaeus • DA 8::IRGC 6422-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPAK
۲۹. IRGC 117460Oryza sativa Linnaeus • DA 9::IRGC 5854-1 • سویه ژنتیکی • بنگلادش+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPBM
۳۰. IRGC 117462Oryza sativa Linnaeus • DAWASAM (RED)::IRGC 32389-1 • سویه ژنتیکی • باتان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPDP
۳۱. IRGC 117463Oryza sativa Linnaeus • DE ABRIL::IRGC 50463-1 • سویه ژنتیکی • برزیل+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPEQ
۳۲. IRGC 117466Oryza sativa Linnaeus • DOM ZARD::IRGC 12881-1 • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPHT
۳۳. IRGC 117467Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 32292-1 • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPJV
۳۴. IRGC 117470Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 10984-1 • سویه ژنتیکی • ماداگاسکار+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPNY
۳۵. IRGC 117471Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 32390-1 • سویه ژنتیکی • باتان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPPZ
۳۶. IRGC 117475Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 32303-1 • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPT=
۳۷. IRGC 117476Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 32306-1 • سویه ژنتیکی • ایران+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPVU
۳۸. IRGC 117478Oryza sativa Linnaeus • GIE 57::IRGC 8231-1 • سویه ژنتیکی • ویتنام+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CPX1
۳۹. IRGC 117481Oryza sativa Linnaeus • GOMPA 2::IRGC 12894-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQ04
۴۰. IRGC 117483Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 17054-1 • سویه ژنتیکی • تایوان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQ26
۴۱. IRGC 117484Oryza sativa Linnaeus • HAWM OM::IRGC 23729-1 • سویه ژنتیکی • تایلند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQ37
۴۲. IRGC 117491Oryza sativa Linnaeus • ILIS AIR::IRGC 43400-1 • سویه ژنتیکی • اندوزی+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQAE
۴۳. IRGC 117492Oryza sativa Linnaeus • :IRGC 33130-1 • سویه ژنتیکی • مایانمار+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQBF
۴۴. IRGC 117494Oryza sativa Linnaeus • JC 1::IRGC 9091-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQDH
۴۵. IRGC 117495Oryza sativa Linnaeus • JC 101::IRGC 9060-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQEJ
۴۶. IRGC 117496Oryza sativa Linnaeus • JC 111::IRGC 9062-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQFK
۴۷. IRGC 117498Oryza sativa Linnaeus • JC 157::IRGC 9074-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQHN
۴۸. IRGC 117500Oryza sativa Linnaeus • JC 91::IRGC 9177-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQKQ
۴۹. IRGC 117501Oryza sativa Linnaeus • JC 92::IRGC 9176-1 • سویه ژنتیکی • هند+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQMR
۵۰. IRGC 117502Oryza sativa Linnaeus • JHONA 26::IRGC 27967-1 • سویه ژنتیکی • پاکستان+ افزودن به فهرست من
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CQNS