Subconjunto

High-density rice array (HDRA) RDP1

These are entries in the panel from USDA/Cornell for use on the high-density rice array (HDRA) comprised of 700K single-nucleotide polymorphisms (SNPs). The HDRA represented the most densely populated genotyping array available for any organism at that time, based on the number of SNPs/kb interrogated across the genome. The value of these resources for genome-wide association studies (GWAS) was explored using grain length as the phenotype, and use numerous analytical techniques to identify significant associations that uncover both major and minor QTLs. Distinct advantages of cross-population mapping were demonstrated, gaining power by directly accounting for large effect alleles from within the mapping model. It was shown how this may lead to the identification of population-specific haplotypes, which are of particular value to the plant breeder.

McCouch et al 2016, Open access resources for genome-wide association mapping in rice, Nature Comm. 10.1038/ncomms10532

Culturas
Rice
Número de acessos
410
Data de criação
2016

Metadados do subconjunto


Criadores do subconjunto


Tratador de dados
Dr. Kenneth L. McNally IRRI

Dados e recursos


Dados de passaporte MCPD

MCPD - 1962c499-dc2c-46f8-8202-24b5ec445f38.xlsx

Apply custom filters to accessions in this subset

Explore subset accessions on the map

Entradas

Lista de entradas incluídas no subconjunto

1. IRGC 117264Oryza sativa Linnaeus • AZUCENA • Estoque genético • Filipinas+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZFQ
2. IRGC 117265Oryza sativa Linnaeus • DOM SUFID • Estoque genético • República Islâmica do Irã+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/1PG6J
3. IRGC 117266Oryza sativa Linnaeus • DULAR • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZGR
4. IRGC 117267Oryza sativa Linnaeus • FR 13 A • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZHS
5. IRGC 117268Oryza sativa Linnaeus • IR 64-21 • Estoque genético • Filipinas+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZJT
6. IRGC 117269Oryza sativa Linnaeus • LI-JIANG-XIN-TUAN-HEI-GU • Estoque genético • China+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZKV
7. IRGC 117270Oryza sativa Linnaeus • M 202 • Estoque genético • Estados Unidos+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZMW
8. IRGC 117271Oryza sativa Linnaeus • MINGHUI 63 • Estoque genético • China+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZNX
9. IRGC 117272Oryza sativa Linnaeus • MOROBEREKAN • Estoque genético • Guiné+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZPY
10. IRGC 117273Oryza sativa Linnaeus • N 22 • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZQZ
11. IRGC 117274Oryza sativa Linnaeus • NIPPONBARE • Estoque genético • Japão+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZR*
12. IRGC 117276Oryza sativa Linnaeus • SADU CHO • Estoque genético • República da Coréia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZT$
13. IRGC 117277Oryza sativa Linnaeus • SANHUANGZHAN NO 2 • Estoque genético • China+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZV=
14. IRGC 117279Oryza sativa Linnaeus • TAINUNG 67 • Estoque genético • Taiwan+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZX0
15. IRGC 117280Oryza sativa Linnaeus • ZHENSHAN 97 B • Estoque genético • China+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZY1
16. IRGC 117282Oryza sativa Linnaeus • CYPRESS • Estoque genético • Estados Unidos+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CMZD
17. IRGC 117599Oryza sativa Linnaeus • 27 • Estoque genético • República Dominicana+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X45S
18. IRGC 117600Oryza sativa Linnaeus • AIJIAONANTE • Estoque genético • China+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X46T
19. IRGC 117601Oryza sativa Linnaeus • ARC 10177 • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X47V
20. IRGC 117602Oryza sativa Linnaeus • ARC 6578 • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X48W
21. IRGC 117603Oryza sativa Linnaeus • ARC 7229 • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X49X
22. IRGC 117604Oryza sativa Linnaeus • ASD 1 • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4AY
23. IRGC 117605Oryza sativa Linnaeus • BASMATI 1 • Estoque genético • Paquistão+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4BZ
24. IRGC 117606Oryza sativa Linnaeus • C57-5043 • Estoque genético • Estados Unidos+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4C*
25. IRGC 117607Oryza sativa Linnaeus • CAROLINA GOLD • Estoque genético • Estados Unidos+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4D~
26. IRGC 117608Oryza sativa Linnaeus • CAROLINA GOLD SEL • Estoque genético • Estados Unidos+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4E$
27. IRGC 117609Oryza sativa Linnaeus • CS-M3 • Estoque genético • Estados Unidos+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4F=
28. IRGC 117610Oryza sativa Linnaeus • DZ78 • Estoque genético • Bangladexe+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4GU
29. IRGC 117611Oryza sativa Linnaeus • GERDEH • Estoque genético • República Islâmica do Irã+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4H0
30. IRGC 117612Oryza sativa Linnaeus • GEUMOBYEO • Estoque genético • República da Coréia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4J1
31. IRGC 117613Oryza sativa Linnaeus • HABIGANJ BORO 6 • Estoque genético • Bangladexe+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4K2
32. IRGC 117614Oryza sativa Linnaeus • HON CHIM • Estoque genético • Hong Kong+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4M3
33. IRGC 117615Oryza sativa Linnaeus • IAC 25 • Estoque genético • Brasil+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4N4
34. IRGC 117616Oryza sativa Linnaeus • ITALICA CAROLINA • Estoque genético • Polônia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4P5
35. IRGC 117617Oryza sativa Linnaeus • KASALATH • Estoque genético • Índia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4Q6
36. IRGC 117618Oryza sativa Linnaeus • KERITING TINGGI • Estoque genético • Indonésia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4R7
37. IRGC 117619Oryza sativa Linnaeus • LEUNG PRATEW • Estoque genético • Tailândia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4S8
38. IRGC 117620Oryza sativa Linnaeus • MEHR • Estoque genético • República Islâmica do Irã+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4T9
39. IRGC 117621Oryza sativa Linnaeus • MOROBEREKAN • Estoque genético • Guiné+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4VA
40. IRGC 117622Oryza sativa Linnaeus • RTS 14 • Estoque genético • Vietnã+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4WB
41. IRGC 117623Oryza sativa Linnaeus • BR24 • Estoque genético • Bangladexe+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4XC
42. IRGC 117624Oryza sativa Linnaeus • KIUKI NO. 46 • Estoque genético • Japão+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4YD
43. IRGC 117625Oryza sativa Linnaeus • SML 242 • Estoque genético • Suriname+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X4ZE
44. IRGC 117626Oryza sativa Linnaeus • WC 4419 • Estoque genético • Honduras+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X50F
45. IRGC 117627Oryza sativa Linnaeus • 1021 • Estoque genético • Guatemala+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X51G
46. IRGC 117628Oryza sativa Linnaeus • 205 • Estoque genético • República Islâmica do Irã+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X52H
47. IRGC 117629Oryza sativa Linnaeus • 318 • Estoque genético • Turquia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X53J
48. IRGC 117630Oryza sativa Linnaeus • 519 • Estoque genético • Uruguai+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X54K
49. IRGC 117631Oryza sativa Linnaeus • 56-122-23 • Estoque genético • Tailândia+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X55M
50. IRGC 117632Oryza sativa Linnaeus • 583 • Estoque genético • Equador+ Adicionar à minha lista
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4X56N