Подгруппа данных

20 OryzaSNP

These 20 diverse varieties and landraces were used for SNP discovery by tiling arrays. Resequencing microarrays were used to interrogate 100 Mb of the unique fraction of the reference genome that captured the impressive genotypic and phenotypic diversity of domesticated rice. Introgression patterns of shared SNPs revealed the breeding history and relationships among the 20 varieties; some introgressed regions are associated with agronomic traits that mark major milestones in rice improvement.

The study was done by Dr. Kenneth L. McNally, et al. in 2009 in https://www.pnas.org/content/early/2009/07/10/0900992106

Сельскохозяйственные культуры
Rice
Количество образцов
20
Дата создания
2009

Метаданные суб-набора


Создатели подгрупп данных


Куратор данных
Kenneth McNally International Rice Research Institute

Данные и ресурсы


Паспортные данные MCPD

MCPD - 0b2a6451-05a9-4a8c-8531-20cd8cb52cd0.xlsx

Apply custom filters to accessions in this subset

Explore subset accessions on the map

Образцы

Список образцов, содержащихся в суб-наборе данных

1. IRGC 117264Oryza sativa Linnaeus • AZUCENA • Генетический фонд • Филиппины+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZFQ
2. IRGC 117265Oryza sativa Linnaeus • DOM SUFID • Генетический фонд • Иран+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/1PG6J
3. IRGC 117266Oryza sativa Linnaeus • DULAR • Генетический фонд • Индия+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZGR
4. IRGC 117267Oryza sativa Linnaeus • FR 13 A • Генетический фонд • Индия+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZHS
5. IRGC 117268Oryza sativa Linnaeus • IR 64-21 • Генетический фонд • Филиппины+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZJT
6. IRGC 117269Oryza sativa Linnaeus • LI-JIANG-XIN-TUAN-HEI-GU • Генетический фонд • Китай+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZKV
7. IRGC 117270Oryza sativa Linnaeus • M 202 • Генетический фонд • США+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZMW
8. IRGC 117271Oryza sativa Linnaeus • MINGHUI 63 • Генетический фонд • Китай+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZNX
9. IRGC 117272Oryza sativa Linnaeus • MOROBEREKAN • Генетический фонд • Гвинея+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZPY
10. IRGC 117273Oryza sativa Linnaeus • N 22 • Генетический фонд • Индия+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZQZ
11. IRGC 117274Oryza sativa Linnaeus • NIPPONBARE • Генетический фонд • Япония+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZR*
12. IRGC 117275Oryza sativa Linnaeus • POKKALI • Генетический фонд • Индия+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZS~
13. IRGC 117276Oryza sativa Linnaeus • SADU CHO • Генетический фонд • Южная Корея+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZT$
14. IRGC 117277Oryza sativa Linnaeus • SANHUANGZHAN NO 2 • Генетический фонд • Китай+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZV=
15. IRGC 117278Oryza sativa Linnaeus • SWARNA • Генетический фонд • Индия+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZWU
16. IRGC 117279Oryza sativa Linnaeus • TAINUNG 67 • Генетический фонд • Тайвань+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZX0
17. IRGC 117280Oryza sativa Linnaeus • ZHENSHAN 97 B • Генетический фонд • Китай+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/4WZY1
18. IRGC 117281Oryza sativa Linnaeus • ASWINA • Генетический фонд • Бангладеш+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CMYC
19. IRGC 117282Oryza sativa Linnaeus • CYPRESS • Генетический фонд • США+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CMZD
20. IRGC 117283Oryza sativa Linnaeus • RAYADA • Генетический фонд • Бангладеш+ Добавить в мой список
PHL001International Rice Research Institute, Philippines • DOI: 10.18730/5CN0E