Подгруппа данных

Cassava core collection

International Institute of Tropical Agriculture maintains 2544 cassava accessions (Manihot esculenta Crantz) from 28 countries in its field bank. Being vegetatively propagated, this poses challenges in maintenance in terms of cost as well as in labour requirements. A core collection representing the range of phenotypic diversity present in the entire collection would enhance the conservation aspects and increase the potential for its exploitation in crop improvement programmes.

The present study aimed to establish a core collection using 40 agro-morphological traits evaluated at two locations using a different number of accessions in each location. To meet the challenges generated by the types of variables and include maximum diversity in the core collection, a sequential strategy based on five major concepts was used: hierarchical multiple factor analysis allowing the mixture of variables of different kinds; three-way analysis that included the effect of genotype × environment interaction in the clustering process; linear discriminant function to assign all those individuals who were included in one location but not in the other to the groups that were generated from the common number of accessions evaluated in both locations; and D-allocation method to select samples from each cluster.

The representativeness of the core subset to the entire collection was further estimated by comparing means and variances, range, and distances between accessions. The established cassava core collection consisted of 428 accessions that conserved 15% higher phenotypic diversity with no redundancies. The phenotypic diversity represented in this core collection will be a guide to users of cassava germplasm in their crop improvement programmes.

Сельскохозяйственные культуры
Cassava
Количество образцов
283
Дата создания
July 5, 2012

Метаданные суб-набора


Создатели подгрупп данных


Куратор данных
Abberton Michael International Institute of Tropical Agriculture (IITA)
Куратор данных
Ranjana Bhattacharjee International Institute of Tropical Agriculture (IITA)
Куратор данных
Dominique Dumet
Куратор данных
Paul Ilona International Institute of Tropical Agriculture (IITA)
Куратор данных
Folarin Soyode

Данные и ресурсы


Паспортные данные MCPD

MCPD - c7e8b6b4-4670-4a4c-97e3-595959c819ad.xlsx

Apply custom filters to accessions in this subset

Explore subset accessions on the map

Образцы

Список образцов, содержащихся в суб-наборе данных

1. TMe-3Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3YR2
2. TMe-14Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3Z3D
3. TMe-18Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3Z7H
4. TMe-20Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3Z9K
5. TMe-26Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3ZER
6. TMe-27Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Republic of the Congo+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3ZFS
7. TMe-37Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3ZQ~
8. TMe-47Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M3ZZ4
9. TMe-51Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M4016
10. TMe-54Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M4038
11. TMe-62Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M40BG
12. TMe-65Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M40EK
13. TMe-67Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M40FM
14. TMe-76Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M40PV
15. TMe-95Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M4166
16. TMe-102Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M41AA
17. TMe-104Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M41CC
18. TMe-109Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M41FF
19. TMe-113Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M41JJ
20. TMe-119Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M41PP
21. TMe-130Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Cape Verde+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M41WW
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M42E9
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M42HC
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M42RK
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M42XR
26. TMe-176Manihot esculenta Crantz • Линия от селекционера • Cameroon+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M42ZT
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M432X
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M435*
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M436~
30. TMe-218Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M441Q
31. TMe-225Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M448Y
32. TMe-237Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M44J3
33. TMe-247Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Republic of the Congo+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M44TB
34. TMe-251Manihot esculenta Crantz • Линия от селекционера • Ghana+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M44XE
35. TMe-264Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Ghana+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M456Q
36. TMe-266Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M458S
37. TMe-268Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M45AV
38. TMe-269Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M45BW
39. TMe-281Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M45P2
40. TMe-299Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M465H
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M466J
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M46FV
43. TMe-312Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Republic of the Congo+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M46HX
44. TMe-318Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Brazil+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M46Q=
45. TMe-320Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Brazil+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M46RU
46. TMe-323Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Brazil+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M46V2
47. TMe-361Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Brazil+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M47W=
48. TMe-362Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Brazil+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M47XU
49. TMe-383Manihot esculenta Crantz • Традиционный сорт/местный сорт • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M48FH
50. TMe-418Manihot esculenta Crantz • Линия от селекционера • Nigeria+ Добавить в мой список
NGA039International Institute of Tropical Agriculture, Nigeria • DOI: 10.18730/M49GD