Details Institut

International Rice Research Institute

The IRRI genebank in Los Baños, Philippines, holds the world's largest collection of rice diversity, with more than 127,000 accessions of cultivated rice and wild relatives. About 38% of the accessions are traditional cultivars or landraces, 11% are breeding materials or advanced cultivars and 3% are wild relatives. (Most of the rest are "not classified".) Over the past 25 years the genebank has distributed about 228,000 samples to 103 countries.

Genebank accessions have been instrumental in creating all of the high-yielding rice varieties released by IRRI over the years. They have also been invaluable to rice breeders in national programmes. A recent study found that 90% of the varieties released by national programmes included at least one IRRI accession in their pedigree.

Except for a small number of wild relatives that cannot be conserved as seed, all accessions are maintained in an active collection at 2-4°C and at -20°C for long-term storage. Seed is tested regularly for viability and regenerated if the germination rate falls below 85%. IRRI is also researching ways to extend the longevity of seeds in storage and to predict viability more accurately.

Characterisation of the accessions for phenotypical and molecular characteristics is an important genebank activity. Data are shared through Genesys and through the International Rice Genebank Collection Information System (IRGCIS). IRRI accessions and scientists also played a large part in the effort to sequence 3000 rice genomes, and IRRI now leads the International Rice Informatics Consortium, which aims to sequence and make data available on as much rice diversity as possible.

About 95% of the accessions at IRRI are safety duplicated both in the Svalbard Global Seed Vault and in the National Center for Genetic Resources Preservation in the USA.

Code Institut
PHL001
Typ
CGIAR
Akzessionen in Genesys
Standort
Längengrad
14.1691
Breitengrad
121.2554
Am häufigsten vertretene Anbaupflanzen
Nicht spezifiziert
22
Am häufigsten vertretene Anbaupflanzennamen
rice
138,862
Nicht spezifiziert
22
Am häufigsten vertretene Gattungen
Oryza
Leersia
Hygroryza
Echinochloa
Rhynchoryza
Sonstiges
4
Am häufigsten vertretene Arten
Oryza sativa
Oryza glaberrima
Oryza nivara
Oryza rufipogon
Oryza sp.
Sonstiges
2,363
Letzte Aktualisierungen von Pflanzenpassdaten
10 October 2019
1 October 2019
30 September 2019
27 September 2019
PDCI: „Vollständigkeitsindex Pflanzenpassdaten“ (Passport Data Completeness Index)
Genesys verwendet den PDCI als Indikator der Vollständigkeit veröffentlichter Pflanzenpassdaten. Der PDCI verwendet die An- oder Abwesenheit von Datenpunkten in der Dokumentation einer Genbank-Akzession und berücksichtigt dabei die Anwesenheit oder den Wert der sonstigen Datenpunkte.(van Hintum et al. 2011)Beispielsweise sollte eine wilde Akzession eine umfassend definierte Sammelstelle, aber keine Unterart-Bezeichnung haben. Der PDCI reicht von 0 bis 10, wobei 0 der Mindestscore ist, der eher unvollständigen Pflanzenpassaufzeichnungen zugewiesen wird. 10 ist der Höchstscore, der sehr vollständigen Pflanzenpassaufzeichnungen zugewiesen ist. Jeder Akzessionstyp – wild, Landrasse, Zuchtmaterial oder moderne Unterart – kann den PDCI-Höchstscore erreichen.
Anzahl der Pflanzenpassaufzeichnungen
30000
22500
15000
7500
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
„Vollständigkeitsindex Pflanzenpassdaten“ (Passport Data Completeness Index, PDCI)
Der durchschnittliche PDCI-Score für 130,622 Akzessionen liegt bei 6.00, der Mindestscore bei 2.85 und der Höchstscore bei 8.40.