جزییات موسسه

International Rice Research Institute

The IRRI genebank in Los Baños, Philippines, holds the world's largest collection of rice diversity, with more than 127,000 accessions of cultivated rice and wild relatives. About 38% of the accessions are traditional cultivars or landraces, 11% are breeding materials or advanced cultivars and 3% are wild relatives. (Most of the rest are "not classified".) Over the past 25 years the genebank has distributed about 228,000 samples to 103 countries.

Genebank accessions have been instrumental in creating all of the high-yielding rice varieties released by IRRI over the years. They have also been invaluable to rice breeders in national programmes. A recent study found that 90% of the varieties released by national programmes included at least one IRRI accession in their pedigree.

Except for a small number of wild relatives that cannot be conserved as seed, all accessions are maintained in an active collection at 2-4°C and at -20°C for long-term storage. Seed is tested regularly for viability and regenerated if the germination rate falls below 85%. IRRI is also researching ways to extend the longevity of seeds in storage and to predict viability more accurately.

Characterisation of the accessions for phenotypical and molecular characteristics is an important genebank activity. Data are shared through Genesys and through the International Rice Genebank Collection Information System (IRGCIS). IRRI accessions and scientists also played a large part in the effort to sequence 3000 rice genomes, and IRRI now leads the International Rice Informatics Consortium, which aims to sequence and make data available on as much rice diversity as possible.

About 95% of the accessions at IRRI are safety duplicated both in the Svalbard Global Seed Vault and in the National Center for Genetic Resources Preservation in the USA.

کد موسسه
PHL001
نوع
CGIAR
کشور
ارائه‌دهنده داده
افزونه‌ها در Genesys
مکان
عرض جغرافیایی
14.1691
طول جغرافیایی
121.2554
محصولات دارای بیشترین نماینده
نامشخص
22
نامهای محصول دارای بیشترین نماینده
rice
138,862
نامشخص
22
سرده‌های دارای بیشترین نماینده
Oryza
Leersia
Hygroryza
Echinochloa
Rhynchoryza
سایر
4
گونه‌های دارای بیشترین نماینده
Oryza sativa
Oryza glaberrima
Oryza nivara
Oryza rufipogon
Oryza sp.
سایر
2,363
تاریخ آخرین به‌روز رسانی داده‌های گذرنامه
11 October 2019
10 October 2019
1 October 2019
30 September 2019
27 September 2019
PDCI: شاخص کامل بودن داده‌های گذرنامه
Genesys از PDCI به عنوان شاخص کامل بودن داده‌های گذرنامه منتشر شده استفاده می‌کند. PDCI از وجود داشتن یا نداشتن امتیازهای داده در مستندات افزونه بانک ژن، با در نظر گرفتن وجود یا ارزش دیگر امتیازهای داده استفاده می‌کند(ون هینتوم و دیگران 2011)مثلاً، افزونه خودرو باید محل جمع‌آوری تعریف شده داشته باشد ولی نام گونه نداشته باشد. مقدار PDCI از 0 تا 10 متغیر است. 0 حداقل نمره داده شده به رکوردهای گذرنامه کاملاً ناقص و 10 حداکثر نمره داده شده به رکوردهای گذرنامه کامل است. هر نوع افزونه، خودرو، محلی، جنس پرورشی یا گونه مدرن ممکن است به حداکثر نمره PDCI دست یابد.
تعداد رکوردهای گذرنامه
30000
22500
15000
7500
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
شاخص کامل بودن داده‌های گذرنامه (PDCI)
میانگین نمره PDCI مربوط به افزونه‌های 130,622 عبارت است از 6.00. نمره کمینه 2.85 و نمره بیشینه 8.40 است.