Detalhes do banco de germoplasma

International Rice Research Institute

The IRRI genebank in Los Baños, Philippines, holds the world's largest collection of rice diversity, with more than 127,000 accessions of cultivated rice and wild relatives. About 38% of the accessions are traditional cultivars or landraces, 11% are breeding materials or advanced cultivars and 3% are wild relatives. (Most of the rest are "not classified".) Over the past 25 years the genebank has distributed about 228,000 samples to 103 countries.

Genebank accessions have been instrumental in creating all of the high-yielding rice varieties released by IRRI over the years. They have also been invaluable to rice breeders in national programmes. A recent study found that 90% of the varieties released by national programmes included at least one IRRI accession in their pedigree.

Except for a small number of wild relatives that cannot be conserved as seed, all accessions are maintained in an active collection at 2-4°C and at -20°C for long-term storage. Seed is tested regularly for viability and regenerated if the germination rate falls below 85%. IRRI is also researching ways to extend the longevity of seeds in storage and to predict viability more accurately.

Characterisation of the accessions for phenotypical and molecular characteristics is an important genebank activity. Data are shared through Genesys and through the International Rice Genebank Collection Information System (IRGCIS). IRRI accessions and scientists also played a large part in the effort to sequence 3000 rice genomes, and IRRI now leads the International Rice Informatics Consortium, which aims to sequence and make data available on as much rice diversity as possible.

About 95% of the accessions at IRRI are safety duplicated both in the Svalbard Global Seed Vault and in the National Center for Genetic Resources Preservation in the USA.

Código do instituto
PHL001
Tipo
CGIAR
Acessos no Genesys
Localização
Latitude
14.1691
Longitude
121.2554
Culturas mais representadas
Não especificado
22
Nomes das culturas mais representadas
rice
138,862
Não especificado
22
Gêneros mais representados
Oryza
Leersia
Hygroryza
Echinochloa
Rhynchoryza
Outro
4
Espécies mais representadas
Oryza sativa
Oryza glaberrima
Oryza nivara
Oryza rufipogon
Oryza sp.
Outro
2,363
Últimas atualizações de dados de passaporte
11 October 2019
10 October 2019
1 October 2019
30 September 2019
27 September 2019
Índice de integralidade de dados de passaporte (PDCI)
O Genesys usa o PDCI como um indicador da integralidade os dados de passaporte publicados. O PDCI usa a presença ou ausência de informações na documentação de um acesso de banco de germoplasma, levando em consideração a presença ou valor de outras informações. (van Hintum et al. 2011). Por exemplo, um acesso silvestre deveria ter um local de coleta bem definido, mas não um nome de variedade. A variação do PCDI é de 0 a 10, onde 0 é o índice mínimo, atribuído a registros de passaporte bem incompletos e 10 é o índice máximo, atribuído a registros de passaporte bem completos. Qualquer tipo de acesso, silvestre, variedade tradicional, variedade moderna ou material melhorado, pode obter o índice PDCI máximo.
Número de registros de passaporte
30000
22500
15000
7500
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Índice de integralidade de dados de passaporte (PDCI)
A pontuação média do PDCI para 130,622 acessos é 6.00, com uma pontuação mínima de 2.85 e uma pontuação máxima de 8.40.