Подробные сведения об учреждении

International Rice Research Institute

The IRRI genebank in Los Baños, Philippines, holds the world's largest collection of rice diversity, with more than 127,000 accessions of cultivated rice and wild relatives. About 38% of the accessions are traditional cultivars or landraces, 11% are breeding materials or advanced cultivars and 3% are wild relatives. (Most of the rest are "not classified".) Over the past 25 years the genebank has distributed about 228,000 samples to 103 countries.

Genebank accessions have been instrumental in creating all of the high-yielding rice varieties released by IRRI over the years. They have also been invaluable to rice breeders in national programmes. A recent study found that 90% of the varieties released by national programmes included at least one IRRI accession in their pedigree.

Except for a small number of wild relatives that cannot be conserved as seed, all accessions are maintained in an active collection at 2-4°C and at -20°C for long-term storage. Seed is tested regularly for viability and regenerated if the germination rate falls below 85%. IRRI is also researching ways to extend the longevity of seeds in storage and to predict viability more accurately.

Characterisation of the accessions for phenotypical and molecular characteristics is an important genebank activity. Data are shared through Genesys and through the International Rice Genebank Collection Information System (IRGCIS). IRRI accessions and scientists also played a large part in the effort to sequence 3000 rice genomes, and IRRI now leads the International Rice Informatics Consortium, which aims to sequence and make data available on as much rice diversity as possible.

About 95% of the accessions at IRRI are safety duplicated both in the Svalbard Global Seed Vault and in the National Center for Genetic Resources Preservation in the USA.

Код учреждения
PHL001
Тип
CGIAR
Страна
Поставщик данных
Образцы в проекте Genesys
Местоположение
Широта
14.1691
Долгота
121.2554
Наиболее широко представленные культуры
Не указано
22
Названия наиболее широко представленных культур
rice
138,862
Не указано
22
Наиболее широко представленные роды
Oryza
Leersia
Hygroryza
Echinochloa
Rhynchoryza
Прочее
4
Наиболее широко представленные виды
Oryza sativa
Oryza glaberrima
Oryza nivara
Oryza rufipogon
Oryza sp.
Прочее
2,363
Последние обновления паспортных данных
11 October 2019
10 October 2019
1 October 2019
30 September 2019
27 September 2019
PDCI: Индекс полноты паспортных данных
Проект Genesys использует PDCI как индикатор полноты опубликованных паспортных данных. PDCI использует наличие или отсутствие тех или иных элементов данных в документации на образец, находящийся в банке генетических ресурсов, при этом учитывается наличие или значимость других элементов данных.(van Hintum et al. 2011)Например, дикий образец должен иметь хорошо описанное место сбора, но для него не указывается название сорта. PDCI выражается числом от 0 до 10, где 0 — минимальное значение, присваиваемое почти незаполненному паспорту, а 10 означает, что паспортная документация заполнена практически полностью. Максимальный балл PDCI может быть присвоен любому типу образца: дикому, культурному, селекционному материалу или современному сорту.
Количество паспортных документов
30000
22500
15000
7500
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Индекс полноты паспортных данных (PDCI)
Средний балл PDCI для 130,622 образцов составляет 6.00, при этом минимальная оценка составляет 2.85 баллов, а максимальная — 8.40 баллов.